טיפים לזיהוי COVID-19

כדי לתמוך בזיהוי של נגיף קורונה חדש (COVID-19) ומחקר ופיתוח חיסונים, המרכזים האמריקניים לבקרת מחלות ומניעה (CDC) והממשלה הסינית סיימו את רצף הגנום החדש של נגיף הקורונאב והגישו את התוצאות ל- NCBI GenBank האמריקני. ® מסד נתונים]. לאחרונה IDT קיבלה פניות מחוקרים ברחבי העולם אודות ערכת הגילוי החדשה לווירוס קורונוויר. להלן תיאור קצר.

מרכזים אמריקאים לבקרת מחלות ומניעה

ערכת בדיקות למרכזים לבקרת מחלות ומניעה בארה"ב * מכוונת לאתרים שונים בגן החלבון ה- Nucleocapsid COVID-19. יש להפעיל את שלוש מערכות הפריימרים / הבדיקות בערכה זו במקביל לבקרה הפנימית שמכוונת לגן RNase P האנושי. סך כל בדיקות ה- 4 qPCR נדרשות לכל דגימת מטופל.

1. ערכת הגילוי משתמשת בתגובת qPCR שלב אחד (כלומר, תעתיק הפוך ותגובות qPCR עוקבות אחר כך מסתיימות באותו שלב);

2. ניתן לבחון את כל 3 בדיקות הגן N כתוצאה חיובית רק כאשר Cq 0010010 lt; 35;

3. תגובת הבקרה הפנימית של RNase P היא המפתח. Cq 0010010 gt; 3 5 פירושו כי מיצוי הדגימה אינו טוב וצריך לחזור על הניסוי;

אנא עיין במרכזים האמריקניים האחרונים לבקרת מחלות ומניעה COVID-19 RT-PCR מדריך למעבדות שיטות בדיקה לקבלת מסמכים רלוונטיים ופרוטוקולים ניסויים.

השוואה עם ערכות בדיקה אחרות

ארגון הבריאות העולמי (WHO)

תכנית הניסוי של ארגון הבריאות העולמי שונה מהתוכניות הניסויים האמריקאים לבקרת מחלות ומניעה. ארגון הבריאות העולמי ממליץ על שלוש תגובות qPCR כדי לאשר האם COVID-19 נגוע. למרות שמדובר במערך שלם של פרוטוקולים ניסויים, אין שיטת בדיקת CDC אמריקאית מהירה יותר מכיוון שהיא דורשת שלוש בדיקות רצופות ויש להקפיד על תוצאה חיובית לפני הבדיקה הבאה. פרוטוקול הניסוי נבדק בסדר הבא:

1. גן E של Coronavirus

2. גן RdRP: מיקוד לווירוס ה- SARS ולנגיף קורונה אחר עם עטלף

3. גן RdRP: מיקוד ל- COVID-19

המרכז הסיני לבקרת מחלות ומניעתן

ערכת הגילוי של המרכז הסיני לבקרת מחלות ומניעה ממליצה להשתמש ב 2 סטים של פריימרים / בדיקות. הקבוצה 1 ממוקדת ל- ORF 1 ab, והקבוצה 2 משמשת לאישור הגן N של COVID-19.

קבוצת שליטה

ניתוח סימולציה אלקטרונית מקדים מראה כי השילוב של תבנית בקרה חיובית ל- NT-N N ** לבין ערכת בדיקת ה- CDC האמריקאית דומה לשימוש בערכות פריימר / בדיקה של ה- CDC הסיני, משרד הבריאות התאילנדי, ו- HKU התוצאות שהתקבלו לפי הניסוי הם עקביים. כמובן שזה מבוסס על מחקר סימולציה אלקטרונית, ומומלץ למשתמשים לאמת את הערכה שנבחרה במעבדה שלהם.

למידע נוסף בקר באתר www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents